合成生物学、基因组设计合成与诊疗应用、DNA智能制造技术

人工基因组的设计与合成；合成基因组学B；人工基因组的设计与合成实验；基因组设计合成实验；合成生物学专业综合实验

中国化工学会生物化工青年工作委员会，委员；

《中国科学：生命科学》，青年编委；

《SCIENCE CHINA Life Sciences》，青年编委。

2024年，天津大学第十二届优秀教案二等奖；

2023年，第三届全国本科院校化工类专业教师课程思政能力竞赛二等奖；

2023年，天津大学优秀师友导师；

2023年，天津大学化工学院优秀教师；

2022年，“天津高校第十六届青年教师教学竞赛”工科组二等奖；

2022年，“天津高校第十六届青年教师教学竞赛”天津大学选拔赛工科组一等奖；

2022年，天津大学青年教工示范岗；

2021年，中国化工学会基础研究成果一等奖，人工酵母基因组的精准可控重排（排名5/7）；

2019年，天津市自然科学特等奖，酵母长染色体的精准定制合成 （排名7/8）;

2019年，天津大学化工学院教育教学贡献奖；

2018年，中国医药生物技术十大进展；

2017年，入选中国科协”青年人才托举工程“项目。

国家重点研发计划青年项目，迷你染色体的设计构建与应用，2022-2027，主持；

国家重点研发计划青年项目，精准合成修饰蛋白质的酵母底盘细胞的设计与构建，2020-2024，参与；

国家自然科学基金面上项目，聚合酶链式组装法构建双链DNA片段的关键调控序列特征解析与智能拆分研究，2024-2027，主持；

国家重点研发计划项目，DNA片段智能制造关键技术研究，2020-2021，主持；

国家自然科学基金青年项目，复合抑制剂耐受酵母的环形染色体基因拷贝数变异热点检测研究，2020-2022，主持。

1. Wen J. R., Xie H. Y., Xie Z. X.* & Yuan Y. J. (2025) Exogenous and endogenous optimization for efficient nonconical amino acids incorporation in Saccharomyces cerevisiae, Chem Eng J. 508.

2. Zheng Y.#, Cui X. C.#, Guo F., Dou M. L., Xie Z. X.* & Yuan Y. J.* (2025) Design and structure of overlapping regions in PCA via deep learning, Synth Syst Biotechnol. 10, 442-451.

3. Zheng Y., Song K., Xie Z. X., Han M. Z., Guo F.* & Yuan Y. J.* (2023) Machine learning-aided scoring of synthesis difficulties for designer chromosomes, Sci China Life Sci. 66, 1615-1625.

4. Wang W. Y., Cai H. Q., Qu S. Y., Lin W. H., Liang C. C., Liu H., Xie Z. X.* & Yuan Y. J. (2022) Genomic variation-mediating fluconazole resistance in yeast, Biomolecules. 12, 845.

5. Xie Z. X.#, Zhou J.#, Fu J.# & Yuan Y. J.* (2021) Debugging: putting the synthetic yeast chromosome to work, Chem Sci. 12, 5381-5389.

6. Chen S., Xie Z. X.* & Yuan Y. J. (2020) Discovering and genotyping genomic structural variations by yeast genome synthesis and inducible evolution, FEMS Yeast Res. 20, foaa012.

7. Wang J., Xie Z. X., Ma Y., Chen X. R., Huang Y. Q., He B., Jia B., Li B. Z. & Yuan Y. J.* (2018) Ring synthetic chromosome V SCRaMbLE, Nat Commun. 9, 3783.

8. Xie Z. X.#, Mitchell L. A.#, Liu H. M.#, Li B. Z., Liu D., Agmon N., Wu Y., Li X., Zhou X., Li B., Xiao W. H., Ding M. Z., Wang Y., Yuan Y. J. & Boeke J. D.* (2018) Rapid and efficient CRISPR/Cas9-based mating-type switching of Saccharomyces cerevisiae, G3. 8, 173-183.

9. Xie Z. X.#, Li B. Z.#, Mitchell L. A., Wu Y., Qi X., Jin Z., Jia B., Wang X., Zeng B. X., Liu H. M., Wu X. L., Feng Q., Zhang W. Z., Liu W., Ding M. Z., Li X., Zhao G. R., Qiao J. J., Cheng J. S., Zhao M., Kuang Z., Wan, X., Martin J. A., Stracquadanio G., Yang K., Bai X., Zhao J., Hu M. L., Lin Q. H., Zhang W. Q., Shen M. H., Chen S., Su W., Wang E. X., Guo R., Zhai F., Guo X. J., Du H. X., Zhu J. Q., Song T. Q., Dai J. J., Li F. F., Jiang G. Z., Han S. L., Liu S. Y., Yu Z. C., Yang X. N., Chen K., Hu C., Li D. S., Jia N., Liu Y., Wang L. T., Wang S., Wei X. T., Fu M. Q., Qu L. M., Xin S. Y., Liu T., Tian K. R., Li X. N., Zhang J. H., Song L. X., Liu J. G., Lv J. F., Xu H., Tao R., Wang Y., Zhang T. T., Deng Y. X., Wang Y. R., Li T., Ye G. X., Xu X. R., Xia Z. B., Zhang W., Yang S. L., Liu Y. L., Ding W. Q., Liu Z. N., Zhu J. Q., Liu N. Z., Walker R., Luo Y., Wang Y., Shen Y., Yang H., Cai Y., Ma P. S., Zhang C. T., Bader J. S., Boeke J. D. & Yuan Y. J.* (2017) "Perfect" designer chromosome V and behavior of a ring derivative, Science. 355, eaaf4704.

10. Xie Z. X.#, Liu D.#, Li B. Z.#, Zhao M., Zeng B. X., Wu Y., Shen Y., Lin T., Yang P., Dai J., Cai Y., Yang H. & Yuan Y. J.* (2017) Design and chemical synthesis of eukaryotic chromosomes, Chem Soc Rev. 46, 7191-7207.