从事合成生物学研究，聚焦合成基因组学，致力于“提升操纵基因组的能力，探索重塑基因组的极限”。

研究方向包括：

1）超大DNA组装与转移使能技术；

2）酵母基因组设计与合成；

3）哺乳动物染色体设计与合成；

4）人工基因组重排与进化。

生物技术前沿

中国生物工程学会青年工作委员会委员；

合成酵母基因组国际计划（Sc2.0）成员；

基因组编写国际计划（GP-write）成员

开发了两种Mb级DNA高效组装技术，创建了染色体缺陷靶点高效定位方法，设计合成了一条707 kb的酿酒酵母X号染色体和一条1.02 Mb的功能拓展人工染色体；

发展了多种人工染色体转移与重排的新策略，实现了人工染色体重排驱动多种酵母表型进化，揭示了人工染色体重排规律与多种适应性的遗传基础。以通讯/第一作者在Science、Cell Research、Nature Communications、Nucleic Acids Research、National Science Review、ACS synthetic biology等期刊发表论文22篇，相关成果入选中国科学十大进展，主持国家重点研发计划项目、国家重点研发计划青年项目、国家自然科学基金面上项目等，入选国家万人计划青年拔尖人才，中国科协青年人才托举工程、中国工程前沿杰出青年学者、天津市青年科技优秀人才，获得天津市自然科学特等奖、中国化工学会基础研究成果一等奖、吴瑞奖。

1.国家重点研发计划绿色生物制造重点专项青年项目 “工业微生物基因组大片段DNA的设计原理与操纵方法” （项目负责人，2021.07-2024.06）

2.国家重点研发计划合成生物学重点专项项目 “动物染色体设计与合成” （子课题负责人，2020.01-2024.12）

3.国家自然科学基金委面上项目“CRISPR-Cas9依赖的酵母染色体驱动” （项目负责人，2020.01-2023.12）

(1) Hui Xu; Mingzhe Han; Shiyi Zhou; Bing-Zhi Li; Yi Wu*; Ying-Jin Yuan; Chromosome drives via CRISPR-Cas9 in yeast, Nature Communications, 2020, 11(1): 4344 (唯一通讯作者)

(2) Yuan Ma; Shuxin Su; Zongheng Fu; Chu Zhou; Bin Qiao; Yi Wu*; Ying-Jin Yuan*; Convenient synthesis and delivery of a megabase-scale designer accessory chromosome empower biosynthetic capacity, Cell Research, 2024, 34: 309-322 (共同通讯作者)

(3) Bo He; Yuan Ma; Fangfang Tian; Guang-Rong Zhao; Yi Wu*; Ying-Jin Yuan*; YLC-assembly: large DNA assembly via yeast life cycle, Nucleic Acids Research, 2023, 51(15): 8283-8292 (共同通讯作者)

(4) Zong-Heng Fu; Si-Zhe He; Yi Wu*; Guang-Rong Zhao*; Design and deep learning of synthetic B-cell-specific promoters, Nucleic Acids Research, 2023, 51(21): 11967-11979 (共同通讯作者)

(5) Song Bai#; Han Luo#; Hanze Tong; Yi Wu*; Yingjin Yuan; Advances on transfer and maintenance of large DNA in bacteria, fungi, and mammalian cells, Biotechnology Advances, 2024, 76: 108421 (唯一通讯作者)

(6) Yi Wu#; Bing-Zhi Li#; Meng Zhao; Leslie A Mitchell; Ze-Xiong Xie; Qiu-Hui Lin; Xia Wang; Wen-Hai Xiao; Ying Wang; Xiao Zhou; Hong Liu; Xia Li; Ming-Zhu Ding; Duo Liu; Lu Zhang; Bao-Li Liu; Xiao-Le Wu; Fei-Fei Li; Xiu-Tao Dong; Bin Jia; Wen-Zheng Zhang; Guo-Zhen Jiang; Yue Liu; Xue Bai; Tian-Qing Song; Yan Chen; Si-Jie Zhou; Rui-Ying Zhu; Feng Gao; Zheng Kuang; Xuya Wang; Michael Shen; Kun Yang; Giovanni Stracquadanio; Sarah M Richardson; Yicong Lin; Lihui Wang; Roy Walker; Yisha Luo; Ping-Sheng Ma; Huanming Yang; Yizhi Cai; Junbiao Dai; Joel S Bader; Jef D Boeke; Ying-Jin Yuan*; Bug mapping and fitness testing of chemically synthesized chromosome X, Science, 2017, 355(6329): aaf4706 (共同第一作者)

(7) Yi Wu#; Rui-Ying Zhu#; Leslie A Michell; Lu Ma; Rui Liu; Meng Zhao; Bin Jia; Hui Xu; Yun-Xiang Li; Zu-Ming Yang; Yuan Ma; Xia Li; Hong Liu; Duo Liu; Wen-Hai Xiao; Xiao Zhou; Bing- Zhi Li; Ying-JIn Yuan; Jef D Boeke*; In vitro DNA SCRaMbLE, Nature Communications, 2018, 9(1): 1935 (共同第一作者)

(8) Yao Xiong#; Hui Zhang#; Sijie Zhou; Lu Ma; Wenhai Xiao; Yi Wu*; Ying-Jin Yuan; Structural Variations and Adaptations of Synthetic Chromosome Ends Driven by SCRaMbLE in Haploid and Diploid Yeasts, ACS Synthetic Biology, 2023, 12: 689-699 (唯一通讯作者)

(9) Zhou Guo; Hongyi Yin; Lu Ma; Jieyi Li; Jiajun Ma; Yi Wu*; Yingjin Yuan; Direct Transfer Consolidation of Synthetic Yeast Chromosomes by Abortive Mating and Chromosome Elimination, ACS Synthetic Biology, 2022, 11(10): 3264-3272 (唯一通讯作者)

(10) Peixia Wang; Hui Xu; Hao Li; Hebing Chen; Sijie Zhou; Fangfang Tian; Bing-Zhi Li; Xiaochen Bo; Yi Wu*; Ying-Jin Yuan; SCRaMbLEing of a Synthetic Yeast Chromosome with Clustered Essential Genes Reveals Synthetic Lethal Interactions, ACS Synthetic Biology, 2020, 9(5): 1181-1189 (唯一通讯作者)