【AI蛋白质设计】基于分子模拟和人工智能技术的蛋白质定向改造和从头设计
【分子生物物理】通过分子模拟和人工智能,解释生物分子的结构、动力学和功能
无
担任 Journal of the American Chemical Society 期刊审稿人;
担任 International journal of biological macromolecules 期刊审稿人;
担任 Catalysts 期刊客座编辑
以分子模拟技术为出发点,在理论与应用两方面开展了研究工作。理论方面,使用Rust语言开发了分子间结合能计算程序s_mmpbsa,是目前适用于Gromacs软件的最便捷、高效的分子间结合能计算程序;应用方面,开展了酶的理性设计改造与工艺设计、仿生多肽药物载体与材料设计,以及淀粉样聚集抑制剂设计筛选工作。此外,着重关注人工智能在分子模拟、蛋白/多肽设计领域的重要应用,开展 AI4S 研究,开发蛋白质设计改造、用于酶工程的多尺度分子模拟的高效方法。
国家自然科学基金面上项目,肽基PET水解仿酶的仿生设计、定向进化及催化应用(22278314),2023/01/01-2026/12/31,54万,学生参与人;
负责肽基仿酶的序列设计、结构建模与催化机理分析国家自然科学基金面上项目,基于酶催化的肽类分子动态自组装研究(51773149),2018/01/01-2021/12/31,61万,学生参与人;
负责酶催化响应性的自组装多肽的结构与机理的模拟分析
1. J Chem Theory Comput, 2024, 20(2): 532-50.
2. J Am Chem Soc, 2024, 146(14): 9679-87.
3. Angew Chem Int Ed, 2023, 62(41): e202309830.
4. Angew Chem Int Ed, 2021, 60(41): 22424-31.
5. Angew Chem Int Ed, 2018, 57(43): 14032-6.
6. Nano Lett, 2021, 21(15): 6406-15.
7. ACS Nano, 2018, 12: 12305-14.
8. ACS Nano, 2021, 15(6): 9827-40.
9. ACS Nano, 2024, 18(14): 10324-40.
10. Green Chem, 2024, 26(5): 2560-70.